Здание Мальтийской капеллы возводилось по проекту архитектора Дж.Кваренги в стиле классицизма. Внутреннее убранство капеллы - колонны в сочетании с арками, полукруглые своды покрытого росписью потолка, скульптуры ангелов, гипсовые гирлянды и мальтийские кресты - придавало торжественную пышность этому, по сути, небольшому сооружению. При жизни императора Павла в капелле регулярно проходили собрания капитула ордена.
Мальтийская капелла в годы Советской власти долго использовалась как клуб пехотной школы имени Склянского. Большая часть предметов интерьера и утвари в 1928 году была передана музеям Ленинграда. В конце 2002 года в капелле, отреставрированной по инициативе начальника Суворовского училища генерала В.Скоблова, открылся Музей истории кадетских корпусов России.